السيد احمد بن عيسى المهاجر انتقل من البصرة الى حضرموت في اليمن سكن احمد مناطقها واستقبل من قبل أهلها استقبال ترحيب، وكان يفقه الناس ويدرسهم علم اهل البيت، وقد وجه احمد بن عيسى ابناءه للهجرة فاتشروا في الفلبين وتايلند واندونيسيا وماليزيا، وحينها بدأوا بنشر علم اهل البيت عليهم السلام.
أحد الكتاب اسمه فان بن بيرق عنده كتاب اسمه المستوطنات في الجزائر الهندية، وهو مؤرخ قديم يقول في كتابه كان من اهم أسباب انتشار الإسلام في اندونيسيا ان الدعاة الى الإسلام كانوا من احفاد النبي محمد صل الله عليه واله وسلم، وقد لقوا الحفاوة والتجاوب من اهل تلك المناطق أحبوهم واتبعوهم، فهؤلاء احفاد احمد المهاجر باشروا دورهم بالدعوة للإسلام وتعليمه في تلك المناطق.
يوجد فرع اخر من احفاد الامام الصادق وهم احفاد محمد الديباج،
حفيد الديباج عبد العزيز بن علي بن محمد الديباج كان من ضمن المهاجرين لتلك المنطقة وقد انتشروا في مناطق مختلفة منها فبعضهم ذهب لمنطقة جاوه وبعضهم مناطق أخرى وكل واحد بداء يعمل على دعوة الناس الى الإسلام ،عبدالعزيز حفيد الامام الصادق كان ذوا شخصية سوية ودعوته مارسها بأسلوب سلمي واخلاق عالية فاستطاع اقناع امير المنطقة التي اقام فيها بالإسلام وقبل ذلك بقناعة وحب واسلم مع اسرته وزوج عبد العزيز احدى بناته فاصبح وريث العرش بعد ذلك ، فحفيد الامام الصادق عليه السلام الذي كان مضطهد ومحاصر في بلاده البصرة ونواحيها اصبح صهرا لحاكم المنطقة فلما حضرة حاكم المنطقة الوفاة أوصى بالحكم اليه ومن بعده وأولاده واستمرت مدة حكمهم ٨٠ سنة واستمروا خلال تلك السنوات بالدعوة للإسلام ونشره .
ينقل عن كتاب سلسلة محمد الديباج انه كان يروي من أحاديث الرسول ما جاء في حق جده امير المؤمنين (لولا أني أخشى ان تقول فيك طائفة من امتي ما قالته النصارى في المسيح عيسى ابن مريم لقلت فيك قولا لا تمر به على ملاء الا واخذوا من تراب رجليك ومن طهورك يستشفون ولكن حسبك أنك مني وانا منك).
هذه الذرية الهاشمية كان لها الدور الأكبر في تأسيس ونشر الإسلام فهذا أحد اهداف هجرتهم لتلك المناطق وان وجدت فرق أخرى غيرها قامت أيضا بذلك الدور من فرق المسلمين كبعض التجار المسلمين الذين مارسوا ذلك الدور ونشروا الإسلام عبر تعاملهم مع أهالي تلك المناطق الذين أحبوا شخصياتهم واخلاقهم العالية وسلوكياتهم الحميدة.
إذا يوجد عوائل هاشمية كثيرة تنتمي لنسب رسول الله لها أصول تاريخية موجودة في اليمن والفلبين وماليزيا فمثلا تجد في اندونيسيا حاليا عوائل معروفة من السادة مثلا عائلة ال الكاف وفيهم علماء معرفون في وقتنا الحالي سادة وينتهي نسبهم للأمام الصادق عليه السلام وعائلة العيدروس والبار والمحضار والسقاف.
من المعروف ان في حضرموت فئة من الناس يعظمون شخصية احمد بن عيسى يعظمونه تعظيم كبير ولكن منهجهم الفقهي هو المنهج الشافعي وكذلك في اندونيسيا نسبة المسلمين فيها ٨٨%الغالبية المسلمة اصولهم تنتمي للمذهب الشافعي والباقي من الشعب بين المسيحيين وديانات أخرى كالبوذية وغيرها وأخيرا تم الاعتراف بالبهائية كدين من الديانات وهي أحد الديانات المنحرفة التي لها أفكار لا ترتبط كثيرا بالإسلام.
في داخل الدائرة الإسلامية الأكثرية الساحقة والغالبة هي من الشافعية المذهب ولهم طرائق صوفية وبعد هؤلاء يأتي شيعة اهل البيت وعددهم ليس بالكثير، ومن الصعب معرفة العدد الحقيقي لأنه لا يوجد لديهم إحصاء على أساس المذهب وقسم من اتباع المذاهب لا يصرحون به لذلك تختلف التقديرات اختلاف كبير جدا فهناك من يقول ان شيعة اهل البيت في اندونيسيا يبلغون ١٠٠ ألف وبين من يقول انهم يزيدون على المليون فالاختلاف في تقدير العدد كبير جدا ومتفاوت.